Vigilancia molecular de cuerpos de agua continentales

La región de Los Lagos destaca por la gran cantidad de paisajes asociados a cuerpos de agua.
Históricamente, el asentamiento humano en la región se ha realizado junto a estos ambientes, siendo este parte importante del desarrollo económico y social. Lamentablemente, la actividad humana somete a los cuerpos de agua a una presión antrópica que en casos extremos termina por afectar el equilibrio ecológico. La línea de investigación que lideró apunta a estudiar la microbiología asociada de los ambientes acuáticos con el fin de determinar en qué estado sanitario se encuentran. Para ello, utilizamos a los microorganismos como bioindicadores, información que es recopilada a través de la secuenciación metagenómica del ADN y del análisis bioinformático, para el cual es necesario contar con sistemas de computación de alto rendimiento.Utilizamos las capacidades del NLHPC para realizar el ensamblaje de los segmentos de ADN secuenciados, paso crucial para obtener una asignación taxonómica confiable. Pero, además, la infraestructura nos permite utilizar aproximaciones que permiten predecir la existencia de nuevos microorganismos no descritos mediante el ensamblaje de genomas desde secuencias metagenómicas (MAGs, del inglés metagenome-assembled genomes). Estas herramientas las utilizamos para el desarrollo del proyecto Fondecyt de Iniciación que dirijo, titulado “Anthropogenic Perturbation on the Functional and Microbial Community Structure of Urban Wetlands Can Accumulate Biohazard Elements for Environmental, Animal, and Human Health” financiado por la Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID), el cual busca describir qué elementos de riesgo microbiológico y genómico es posible encontrar en humedales urbanos en mal estado de conservación, teniendo en cuenta que estos ecosistemas están en constante presión antrópica.

Crédito imagen: Daniel Medina