Fecha del evento:
19 de noviembre, 2013
15:30 – 16:30
Lugar:
Centro de Modelamiento Matemático
Blanco Encalada 2120, piso 7
Santiago – Chile
Expositor:
Dr. Ruhong Zhou, PhD
Teoría de la materia blanda y Grupo de Simulación,Centro de Biología Computacional, del Centro de Investigación IBM Thomas J. Watson , Yorktown Heights, y Departamento de Química, Columbia University, New York.
Resumen:
“¿Cómo se dobla e interactúa una proteína con otras moléculas?» es todavía un misterio muy grande en la biología molecular a pesar de extensos estudios desde enfoques tanto experimentales como teóricos. En esta charla, les presentaré algunos de nuestros trabajos recientes con simulaciones computacionales masivamente paralelas usando el Blue Gene de IBM, incluyendo efectos de mutación sencilla en mal plegamiento y agregación de proteínas, transición dewetting en nanoescala en plegamiento complejo de proteínas, diseño nanoporo de agua con nanotubos de carbón, ataduras antígeno-anticuerpo y antígeno-receptor de enfermedades infecciosas, así como también interacciones proteína-nanopartícula (nanotoxicidad/nanomedicina). Estas simulaciones a larga escala revelan detallados mecanismos moleculares en plegamientos y mal plegamientos de proteínas, interacciones proteína-proteína y proteína-nanopartícula. Esta charla también describirá brevemente el IBM Blue Gene Project, incluyendo su hardware, software de sistema, y programas de ciencias de aplicaciones.
Breve Bio:
Ruhong Zhou es actualmente Científico y Manager del personal de Investigación de Teoría de la materia blanda y Grupo de Simulación,Centro de Biología Computacional, del Centro de Investigación IBM Thomas J. Watson y Profesor Adjunto del Departamento de química, Columbia University. Recibió su Ph.D. con el Prof. Bruce Berne en química de Columbia University en 1997. Se unió a Investigación IBM en el año 2000, después de haber trabajado dos años y medio con el Prof. Richard Friesner (Columbia Univ) y el Prof. William Jorgensen (Yale Univ) en campos de fuerza polarizable. Ha sido autor y co autor de más de 140 publicaciones en journals y 18 patentes, ha dado mas de 150 charlas como invitado en conferencias mayores y universidades alrededor del mundo, presidido y co presidido muchas conferencias en biología computacional, química computacional y campos de biofísica. Sus intereses en investigación actuales incluyen el desarrollo de nuevos métodos y algoritmos para la biología computacional y la bioinformática, y simulaciones a gran escala para plegamiento proteico, ataduras ligando-receptor, interacción proteína-proteína y proteína-nanopartícula. Es parte del team Blue Gene de IBM quienes ganaran la Medalla Nacional de Tecnología e Innovación en 2009. Ha ganado el Premio a la Innovación Dstacada IBM en 2011, el Premio al Logro Técnico Destacado IBM (el premio técnico más alto en IBM) en 2008 y 2005, el Premio División de Investigación IBM en 2005, el Premio Columbia University Hammett en 1997 (para los mejores graduados), y el Premio DEC de la Sociedad Química Americana en química computacional en 1995. Es Editor jefe del Current Physical Chemistry, Editor Invitado del Nanoscale, Editor de (Nature) Scientific Reports, y también es miembro del Comité Editorial de otras revistas internacionales. Fue elegido AASS Fellow (Asociación Americana para el Avance de la Ciencia) y APS Fellow ( Sociedad Física Americana) en 2011.
